Если на компе стоит криптопро 5.0, то в СБИС-плагине можно включить режим принудительного использования криптопро для работы с токенами со встроенной криптографией.

Для этого в ОС Windows:
1. Выключите плагин
2. Откройте %AppData%\Local\Sbis3Plugin\user-config.ini и добавьте две строки:

[Считыватели]
РежимАктивныхСчитывателейКриптоПро5=true

3. Запустите плагин. Проверьте на cvs.sbis.ru тестирование контейнера.